近日，土壤学传统顶刊Soil Biology and Biochemistry（中科院一区；IF=8.546）在线发表了车荣晓副研究员团队有关DNA提取土壤用量对微生物群落解析影响的研究成果：Soil sample sizes for DNA extraction substantially affect the examination of microbial diversity and co-occurrence patterns but not abundance。太阳成集团tyc234cc研究生李婷为第一作者，车荣晓副研究员为通迅作者。

土壤微生物因其在驱动生物地球化学循环等方面的重要作用而日益受到关注。DNA提取是土壤微生物多样性和多度研究的基础步骤，尽管其很可能深受土壤用量多少的影响，但相关研究仍十分匮乏。基于此，车荣晓研究团队基于采集自荒漠、草甸、森林和农田的土壤样品，系统解析了DNA提取土壤用量（0.01、0.025、0.25、0.50和1.00 g）对原核和真菌群落解析的影响。

图1.DNA提取土壤用量对微生物物种丰富度解析的影响

研究发现：DNA提取土壤用量对微生物多度测定的影响十分微弱，但显著改变了微生物物种丰富度、群落组成和共现模式的解析。在大多数生态系统中，基于0.01和0.025 g土壤所检测到的微生物丰富度和共现频率均大幅低于基于0.25~1.00 g土壤的分析结果。微生物群落组成解析也受≤ 0.50 g土壤用量的显著影响。尤其需要注意的是，基于≤ 0.025 g土壤用量所提取的DNA揭示出土壤微生境间极高的微生物群落异质性。总而言之，在大多数生态系统中，至少应使用0.25 g土壤来解析微生物多样性。对于微生物量较低的土壤，应至少使用0.50 g土壤提取DNA。因此，DNA提取土壤用量会显著影响土壤微生物多样性和共现模式的解析，最佳土壤用量的选定主要取决于土壤类型和研究目的。本研究凸显了DNA提取土壤用量对微生物研究的重要性，为建立土壤微生物分析标准化操作流程提供了关键信息。

图2.DNA提取土壤用量对微生物群落组成分析的影响

图3.基于不同DNA提取土壤用量的微生物共现模式

上述研究得到了国家自然科学基金（42007035；42261012；31971530）、云南省基础研究计划（202101AU070077；202201AT070210）、中国科学院战略先导科技专项（XDA26020203）、云南省基础研究重大计划（202101BCE070002），以及云南大学“双一流”高校建设经费等基金项目的支持。